2262年，地球部队上尉伊丽莎白·洛克利被任命指挥巴比伦5号。该电台越来越成为Psi军团的流氓心灵感应者的避难所，从而引发冲突。前纳恩驻巴比伦5号大使G'Kar在纳恩半人马座战争期间被监禁期间写的一本书出版后，不情愿地成为了精神偶像。德拉克人是留在银河系的阴影的前盟友，他们通过一种名为守护者的寄生生物控制了半人马座主星上的摄政王维里尼，然后煽动半人马座和星际联盟之间的战争，以将半人马座与联盟隔离，并为自己获得一个可塑的家园。半人马座的Prime被Narn和Drazi的战舰摧毁，Londo Mollari成为皇帝，接受了Drakh守护者，面临着地球彻底核毁灭的威胁。（在整个系列中，他的统治结束的部分内容出现在各种有先见之明的画面中；它们展示了莫拉里和前克星（后来的朋友）G'Kar在16年后死于彼此的喉咙，似乎是出于怨恨。人们逐渐发现，还有一个更友好的潜台词，莫拉里已经成为德拉克统治的奴隶，厌倦了生活；他的德拉克守护者觉醒并勒死了G'Kar作为回报。维拉·科托（Vir Cotto）是莫拉里忠诚且更有道德的助手，接替他成为皇帝，不受德拉克的影响。Sheridan和Delenn结婚后搬到了Minbar，以及星际联盟的总部。G'Kar离开巴比伦5号，逃离他不想要的名声，探索边缘。加里波第也结婚并定居在火星上。其他大多数主角都离开了B5。19年后，在死亡的边缘，谢里登最后一次前往废弃的巴比伦5号空间站，然后将其退役。谢里登显然已经死了，但被第一人认领，第一人邀请他加入他们的银河系边缘之外的旅程。谢里登离开后不久，巴比伦5号车站在一次拆除中被毁，由于联盟已经接管了其外交目的，该车站的存在不再必要。最后一集由Straczynski客串，饰演在巴比伦5号被拆除前关灯的技术人员。